Le conseil de département propose la politique pédagogique et gère l’offre de formation en biologie, en concertation avec la commission formation de la faculté. Il a un avis consultatif sur toute question concernant l’enseignement académique et fait remonter ses délibérations au conseil de faculté.

Parmi ses missions, le conseil de département :

•    élit le directeur de département ;
•    définit en concertation étroite avec les structures de recherche associées, les besoins en personnels enseignants-chercheurs permanents ou temporaires ;
•    est consulté pour toute modification ou création de filières de formation comportant des enseignements relevant du département ou impliquant la participation d'enseignants-chercheurs du département ;
•    est consulté sur les demandes d'accréditation de filière d'enseignement dans lesquelles le département est impliqué ;
•    propose des actions de formation continue dispensées en son sein ;
•    propose les responsables de formation et directeurs des études des licences et de masters portés par le département ;
•    demande à la faculté, dans le cadre du contrat d’objectifs, les moyens nécessaires à l'accomplissement de sa mission ;
•    répartit les crédits qui lui sont affectés au titre de l'enseignement ;
•    propose au doyen de la faculté la répartition des enseignements pour l'ensemble du personnel enseignant en fonction dans le département ;
•    attribue les reconnaissances dans le cadre du référentiel des tâches pédagogiques défini par l’université.