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MASTER BIO-INFORMATIQUE

Parcours Méthodes informatiques et statistiques pour les OMICS

Choisissez votre parcours:

  • Durée: 4 semestre(s)
  • Accessible en: Formation initiale , Formation continue
  • Stage: OBLIGATOIRE(S4)
  • Niveau de diplôme requis à l'entrée: BAC+3
  • Niveau de diplôme validé à la sortie: BAC+5
  • 20210525

Objectifs de la formation

Le parcours Méthodes informatiques et statistiques pour les omics (MISO) du master Bioinformatique apporte des compétences de haut niveau dans le domaine de la bioinformatique et de la biostatistique. Ce parcours est dédié aux étudiants et étudiants souhaitant acquérir des compétences et se perfectionner en bioinformatique. Le parcours accueille aussi bien des personnes titulaires d’une licence de biologie que d’informatique ou de mathématique. Certains enseignements seront spécifiques selon la filière d’origine de l’étudiant-e.

En étroite liaison avec les équipes de recherche de bioinformatique et biostatistique de l’université de Lille ainsi qu’avec la plateforme lilloise de bioinformatique et biostatistique, le parcours vise à faire découvrir progressivement et à permettre la maîtrise des méthodes informatiques et statistiques utilisées pour l’analyse informatique et statistique de données biologiques. Les quantités de données produites nécessitent des outils spécifiques pour l’analyse de données génomiques, de réseaux métaboliques, etc.

Spécificités de la formation

  • Le parcours MISO est adossé à des équipes de recherche en bioinformatique et en biostatistique. Les intervenantes et intervenants du master sont activement impliqués dans la recherche en biologie, en bioinformatique ou en biostatistique.
  • Ce parcours se fait également en partenariat avec Bilille, la plateforme de bioinformatique et biostatistique lilloise qui répond aux demandes d’ingénierie bioinformatique des laboratoires de recherche lillois. Durant le cursus un projet sera à mener, en collaboration avec des ingénieur-e-s de la plateforme. Un autre projet, proposé par les laboratoires de l’université de Lille, portera sur des aspects de développement bioinformatique. Le cursus se termine pas un stage de 6 mois.
  • Le parcours MISO a été pensé pour intégrer des étudiant-e-s de cursus différents (biologie, informatique, mathématique). Certaines des matières dépendront du cursus initial des étudiant-e-s.

Compétences visées

L’analyse de données biologiques (génomiques, protéomiques, réseaux métaboliques, …) toujours plus abondantes est rendue possible par des méthodes informatiques et statistiques toujours plus efficaces. L’objectif de MISO est d’appréhender ces méthodes, de les utiliser, de se familiariser avec pour l’étude de données biologiques. Le parcours MISO se divise en trois blocs de compétence : bioinformatique, biostatistique et informatique.

  • bioinformatique : savoir choisir, installer, utiliser et paramétrer des outils bioinformatiques adaptés à une question donnée, savoir interpréter les résultats obtenus et avoir un recul critique sur ceux-ci.
  • biostatistique : connaître et savoir utiliser des analyses statistiques, savoir choisir un modèle adapté, pouvoir mettre en oeuvre des analyses statististiques avec R.
  • informatique : savoir mettre en oeuvre un algorithme bioinformatique en faisant des choix adaptés, savoir mettre en place des bases de données.

Modalités d'admission/ Conditions d'accès

L’admission en première année de master est subordonnée à l’examen du dossier du/de la candidat-e selon les modalités suivantes :

Modalités de sélection : dossier/entretien

Mentions de licence conseillées  : Informatique, Sciences de la Vie, Sciences pour l'Ingénieur, Sciences pour la santé

Capacité d’accueil  : 20 places en master 1

Calendrier de recrutement  :

  • Ouverture du 12/04/2021 au 01/06/2021
  • Publication admission : 11/06/2021

Critères d’examen du dossier : 

Un dossier détaillé du cursus suivi par la candidate ou par le candidat pour identifier les compétences validées par la formation antérieure.

  • Relevés de notes et diplômes
  • Parcours de Licence
  • Niveau en Anglais
  • Réalisation de stages
  • Motivation
  • Parcours personnel
  • Eventuellement : lettre de recommandation des encadrants de stage

Déposez votre candidature sur la plateforme : https://ecandidat.univ-lille.fr

A titre indicatif, veuillez trouver ci-dessous la maquette des enseignements de l'année 2020/2021, déclinée par semestre et Bloc de Connaissances et de Compétences (BCC). La maquette de l'année 2021/2022 sera consultable à compter du mois d'avril 2021.

Organisation de la formation

  • Le parcours Méthodes informatiques et statistiques pour les omics (MISO) est organisé autour de quatre blocs de connaissances et de compétences (BCC) :
    • BCC1 - BIOINFORMATIQUE
    • BCC2 - BIOSTATISTIQUE
    • BCC3 - INFORMATIQUE
    • BCC4 - PROFESSIONNALISATION
  • Stage de 6 mois au S4.

Programme

UE 2 Option informatique 1 6 crédit(s)
UE 1 Fondements de l'informatique 1 3 crédit(s)
UE 1 Introduction à la Bioinformatique 6 crédit(s)
UE 2 Introduction aux données omiques 3 crédit(s)
UE 3 Analyses Statistiques Univariées et Bivariées 2 3 crédit(s)
UE 1 Langue et Société 3 crédit(s)
UE 2 Option en informatique, biologie ou statistiques 6 crédit(s)
UE 1 Fondements de l’Informatique 2 3 crédit(s)
UE 2 Méthodes pour l’analyse bioinformatique des séquences 9 crédit(s)
UE 1 Analyses statistiques multivariées 2 3 crédit(s)
UE 2 Projet de l'Etudiant 3 crédit(s)
UE 1 Projet de recherche en laboratoire 6 crédit(s)
UE 3 Option en informatique, biologie ou statistiques 2 6 crédit(s)
UE 1 Machine Learning 6 crédit(s)
UE 2 Option informatique 2 3 crédit(s)
UE 1 Génomique Evolutive 3 crédit(s)
UE 2 Bioinformatique Structurale 3 crédit(s)
UE 3 Protéomique et Métabolomique 3 crédit(s)
UE 3 Systems biology and differential analyses 3 crédit(s)
UE 1 Qualité et pré-traitement des données de santé 3 crédit(s)
UE 2 Recherche clinique 3 crédit(s)
UE 1 Technical bibliographic report 3 crédit(s)
UE 1 Biologie Computationnelle de Systèmes 3 crédit(s)
UE 1 Projet de fin d'études 3 crédit(s)
UE 3 Stage 21 crédit(s)
UE 2 Projet de l'Etudiant 3 crédit(s)

Poursuite d'études

Des doctorats dans le domaine de la bioinformatique sont possibles. Des offres sont chaque année disponibles dans la région mais aussi en France (voir par exemple https://frama.link/these-bioinfo) ou à l’étranger.

Insertion professionnelle

  • La bioinformatique est un domaine qui recrute à la fois dans le public et dans le privé.
  • La formation permet une insertion professionnelle à la sortie du master (sur des postes d’ingénieur) ou d’envisager un doctorat pour ensuite intégrer le public ou le privé.
  • Les domaines de l’agronomie, de la santé, des biotechnologies sont particulièrement demandeurs de compétences dans les domaines étudiés durant le parcours MISO.

Retrouvez les études et enquêtes de l’ODiF (Observatoire de la Direction de la Formation) sur l’insertion professionnelle des diplômés de la licence sur : https://odif.univ-lille.fr.

DEPARTEMENT BIOLOGIE


https://sciences-technologies.univ-lille.fr/biologie/

FACULTE DES SCIENCES ET TECHNOLOGIES


Campus Cité scientifique - Université de Lille
59655 Villeneuve d'ascq
https://sciences-technologies.univ-lille.fr/

Responsable Parcours


LEGRAND Sylvain

Responsable Parcours


SALSON Mikael